Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctr9Q62018 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms