Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HlxQ61670 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HlxQ61670 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HlxQ61670 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms