Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hes3Q61657 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hes3Q61657 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms