Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pacsin1Q61644 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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