Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Erbb3Q61526 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Erbb3Q61526 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Erbb3Q61526 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Erbb3Q61526 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Erbb3Q61526 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms