Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ecm1Q61508 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm1Q61508 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms