Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Msi1Q61474 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msi1Q61474 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msi1Q61474 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms