Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccne1Q61457 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms