Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms