Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift88Q61371 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms