Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BcanQ61361 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcanQ61361 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms