Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AcanQ61282 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms