Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hif1aQ61221 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif1aQ61221 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms