Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4bQ61136 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms