Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CybbQ61093 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CybbQ61093 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CybbQ61093 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CybbQ61093 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CybbQ61093 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms