Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NinQ61043 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NinQ61043 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NinQ61043 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NinQ61043 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NinQ61043 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NinQ61043 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NinQ61043 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NinQ61043 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NinQ61043 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NinQ61043 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NinQ61043 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NinQ61043 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NinQ61043 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NinQ61043 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NinQ61043 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NinQ61043 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NinQ61043 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NinQ61043 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NinQ61043 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NinQ61043 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NinQ61043 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NinQ61043 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NinQ61043 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NinQ61043 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NinQ61043 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NinQ61043 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NinQ61043 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NinQ61043 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NinQ61043 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NinQ61043 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NinQ61043 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NinQ61043 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NinQ61043 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NinQ61043 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NinQ61043 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NinQ61043 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NinQ61043 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NinQ61043 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NinQ61043 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NinQ61043 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NinQ61043 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NinQ61043 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NinQ61043 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NinQ61043 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NinQ61043 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NinQ61043 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinQ61043 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinQ61043 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinQ61043 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinQ61043 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NinQ61043 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms