Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Meis1Q60954 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms