Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn2dQ60773 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms