Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyb561Q60720 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyb561Q60720 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms