Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms