Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PtprnQ60673 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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PtprnQ60673 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprnQ60673 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PtprnQ60673 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PtprnQ60673 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PtprnQ60673 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PtprnQ60673 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PtprnQ60673 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PtprnQ60673 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PtprnQ60673 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PtprnQ60673 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms