Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sik1Q60670 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sik1Q60670 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms