Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd5Q5VCS6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms