Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lhfpl4Q5U4E0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms