Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc5a6Q5U4D8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms