Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsr1Q5SWD9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms