Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CluhQ5SW19 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms