Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam71bQ5STT6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms