Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znrf3Q5SSZ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znrf3Q5SSZ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znrf3Q5SSZ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znrf3Q5SSZ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znrf3Q5SSZ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znrf3Q5SSZ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znrf3Q5SSZ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms