Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms