Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85aQ5SP85 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms