Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r209Q5NC97 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r209Q5NC97 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms