Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf3Q5HZG4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms