Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm3Q5F4S9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms