Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CenpjQ569L8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpjQ569L8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms