Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms