Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opa3Q505D7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms