Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc84Q4VA36 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms