Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx49Q4FZF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms