Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt35Q497I4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms