Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd5Q3V1H9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd5Q3V1H9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms