Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2Q3V1H1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms