Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms