Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm12888Q3UW77 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms