Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thsd4Q3UTY6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thsd4Q3UTY6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thsd4Q3UTY6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thsd4Q3UTY6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms