Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox3Q3UT54 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms