Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fchsd2Q3USJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fchsd2Q3USJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fchsd2Q3USJ8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Fchsd2Q3USJ8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fchsd2Q3USJ8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fchsd2Q3USJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fchsd2Q3USJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fchsd2Q3USJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fchsd2Q3USJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms