Protein–RNA interactions for Protein: Q3URF8

Kctd21, BTB/POZ domain-containing protein KCTD21, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd21Q3URF8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kctd21Q3URF8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kctd21Q3URF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms