Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm20Q3UQS8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm20Q3UQS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbm20Q3UQS8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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