Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms